تعتبر المديرية العامة للخدمات الصحية في محافظة الداخلية إحدى مديريات الخدمات الصحية الإحدى عشر المنتشرة في محافظات السلطنة وتعمل على قيادة ومتابعة تنفيذ الخدمات الصحية في المؤسسات الصحية بالمحافظة من خلال شبكة متكاملة من المؤسسات الصحية عالية المقاييس تقدم خدمات صحية علاجية ووقائية وتأهيلية وتعزيزية تتسم بالشمولية وسهولة المنال لجميع فئات المجتمع . وتتشكل منظومة الخدمات الصحية من مراكز صحية منتشرة في جميع ولايات المحافظة ومجمعات صحية في ولايات بهلاء ونزوى وإزكي وسمائل ومستشفيات محلية في ولاية أدم وإزكي و الجبل الأخضر ومستشفيات ولاية في ولايتي بهلاء وسمائل والمستشفى المرجعي في ولاية نزوى . وتقدم المراكز الصحية والمجمعات الصحية والمستشفيات المحلية حزم متكاملة من برامج الرعاية الصحية الاولية بينما تقدم مستشفيات الولايات والمستشفى المرجعي خدمات رعاية صحية ثانوية لتكتمل المنظومة بتحويل الحالات المرضية التي تتطلب رعاية صحية ثالثية إلي المستشفيات بمحافظة مسقط . وتوجد بالمحافظة مبادرات ومشاريع ريادية كانت الأولى من نوعها على مستوى السلطنة وهي مشروع نزوى الأنماط الحياة الصحية ومركز الأرشاد الطلابي ومركز التدريب الوظيفي ومشروع رعاية المسنين وقد تم تعميم بعضها الي باقي محافظات السلطنة بعدما أثبتت نجاحها